Fermentasyon, biyokimyasal reaksiyonlar yoluyla organik bileşiklerin yıkımı veya sentezlenmesi sürecidir. Bu süreçte, mikroorganizmaların (örneğin bakteriler veya mayalar) enzimatik aktivitesi, organik bileşikleri daha basit bileşiklere parçalayarak enerji açığa çıkarmak veya yeni moleküller oluşturmak için kullanılır.
Tıbbi alanda, fermentasyon terimi, genellikle probiyotikler gibi yararlı bakterilerin üretiminde kullanılır. Probiyotikler, vücut için faydalı olan bakteri kültürleridir ve genellikle sindirim sistemi sağlığını desteklemek için kullanılır.
Ayrıca, fermentasyon, antibiyotikler ve diğer ilaçların üretiminde de önemli bir rol oynar. Bu ilaçlar, bakteri veya mantarların büyümesini engelleyen veya öldüren bileşikler içerirler ve bu bileşikler genellikle mikroorganizmalar tarafından fermentasyon yoluyla üretilir.
Son olarak, fermentasyon, alkollü içeceklerin ve ekşi süt ürünlerinin üretiminde de kullanılır. Örneğin, şarap yapımı, üzüm suyu veya başka bir meyve suyunun fermantasyonu yoluyla gerçekleştirilir. Ekşi süt ürünleri ise, sütün laktik asit fermantasyonu yoluyla mayalanması sonucu oluşur.